30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39046 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  100 
 
 
439 aa  907    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  26.33 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  25.57 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  25.18 
 
 
843 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  25.38 
 
 
328 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  23.31 
 
 
329 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 
339 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.4 
 
 
328 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
314 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  40.82 
 
 
324 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.49 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  23.53 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  22.69 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  23.12 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
330 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
328 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  22.61 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  21.77 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.84 
 
 
523 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
367 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
570 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
441 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>