12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38600 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_38600  predicted protein  100 
 
 
703 aa  1460    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0535705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 
160 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  26.43 
 
 
160 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  28.08 
 
 
187 aa  47.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  24.84 
 
 
164 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  22.11 
 
 
308 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  30.08 
 
 
163 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  28.86 
 
 
611 aa  45.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  25.21 
 
 
220 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  23.4 
 
 
161 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  24.67 
 
 
150 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  25 
 
 
167 aa  43.9  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>