More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38165 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  54.76 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  52.45 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.69 
 
 		 201 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  42.39 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  47.17 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.12 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  41.96 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.79 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  42.72 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  42.18 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.19 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  43.06 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  40.47 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.19 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  41.51 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  41.98 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  41.35 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.51 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  37.22 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  42.03 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  36.62 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  36.62 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  37.8 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  39.71 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  37.32 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  43.66 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  41.35 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  37.56 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  40.87 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  39.81 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  37.25 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  35.94 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  42.18 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  41.12 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 210 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 210 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 217 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  38.1 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  38.94 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  34.76 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>