11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38100 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  100 
 
 
133 aa  259  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  48.75 
 
 
1034 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  45.61 
 
 
982 aa  57.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  38.55 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0954  hypothetical protein  39.34 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.167212  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  49.23 
 
 
344 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  44.68 
 
 
245 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  47.95 
 
 
347 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  40.91 
 
 
952 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  33.63 
 
 
253 aa  43.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0903  Chromosome segregation ATPase-like protein  33.85 
 
 
1022 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>