110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37466 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37466  predicted protein  100 
 
 
397 aa  824    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  31.65 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.4 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  26.96 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  31.9 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  31.9 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  27.64 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  28.79 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  22.99 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  24.65 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  27.43 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.99 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.99 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  26.22 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  31.28 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  25.25 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  29 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
351 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  30.57 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
351 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  26.85 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  25.25 
 
 
336 aa  63.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  25 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  24.08 
 
 
334 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  27.56 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  25.18 
 
 
339 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  29.86 
 
 
358 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  25 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  28.72 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
319 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
332 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  25.97 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
347 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
337 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.09 
 
 
329 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.09 
 
 
329 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  25.24 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  27.8 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.37 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  29.51 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.2 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  25.66 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  24.6 
 
 
336 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
340 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
340 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
340 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
332 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
342 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  26.76 
 
 
336 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.41 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  24.41 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.08 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.76 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 
746 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.65 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.65 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.65 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.65 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  25.97 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.78 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  25.34 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0777  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.97 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87094  predicted protein  25.2 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.06869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
326 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2850  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.03 
 
 
655 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
292 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  27.18 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>