42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37109 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37109  predicted protein  100 
 
 		 539 aa  1097    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43491  predicted protein  30.29 
 
 		 563 aa  249  6e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00664754  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37215  predicted protein  32.42 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25.65 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  24.25 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  24.94 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  25.27 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.59 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  23.96 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  24.33 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  22.2 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  26.67 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  23.55 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  24.02 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  24.03 
 
 		 451 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  25.57 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  22.71 
 
 		 458 aa  50.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.92 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  19.9 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 469 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  24.42 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  24.32 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>