50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37038 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37038  predicted protein  100 
 
 
368 aa  771    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.97 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.97 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  26.21 
 
 
3432 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.61 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.61 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.22 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  24.71 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  27.69 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.71 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.71 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.31 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  22.85 
 
 
3404 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  24.32 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.32 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  24.05 
 
 
355 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.6 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.1 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.02 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.1 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  24.61 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  25.1 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  25.1 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  24.61 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  25.1 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.08 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.08 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  23.66 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  23.66 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  23.66 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  23.66 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  23.66 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  24.5 
 
 
4502 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.33 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  22.95 
 
 
357 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  24.32 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  24.05 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.56 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.53 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.26 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.68 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  22.22 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  21.95 
 
 
798 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.05 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  23.55 
 
 
336 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  25.25 
 
 
329 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.58 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  21.2 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  23.42 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  17.59 
 
 
3207 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>