28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36381 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  100 
 
 
515 aa  1078    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  30.86 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  30.34 
 
 
322 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  29.85 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  30.25 
 
 
358 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  28.99 
 
 
389 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  29.38 
 
 
358 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  28.11 
 
 
386 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  29.91 
 
 
337 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  30.65 
 
 
339 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  31.46 
 
 
338 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  28.66 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  29.55 
 
 
342 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  28.44 
 
 
373 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  29.41 
 
 
329 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  29.46 
 
 
375 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  27.41 
 
 
329 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  27.92 
 
 
286 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  29.6 
 
 
317 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  25.82 
 
 
409 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  25.9 
 
 
300 aa  72  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  26.59 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  29.58 
 
 
225 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 
392 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  23.3 
 
 
381 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>