276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3559 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_3559  predicted protein  100 
 
 
351 aa  741    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0310467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  29.66 
 
 
332 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  29.46 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  29.3 
 
 
346 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  27.64 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  28.08 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  26.72 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  27.64 
 
 
374 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  26.7 
 
 
331 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  28.81 
 
 
334 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  26.57 
 
 
331 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  27.68 
 
 
334 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  28.31 
 
 
332 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  26.86 
 
 
331 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  29.05 
 
 
333 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  28.73 
 
 
337 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  28.37 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  28.37 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  30.4 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  26.29 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  26.29 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  26.57 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  29.34 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  28.08 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  28.37 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  28.57 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  26.99 
 
 
332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  27.56 
 
 
332 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  27.92 
 
 
346 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  24.93 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  27.79 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  27.71 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  26.3 
 
 
334 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  26.86 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  26.57 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  29.37 
 
 
333 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  29.37 
 
 
333 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  29.37 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  29.37 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  29.37 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  26.57 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  27.27 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  26.67 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  30.07 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  27.25 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  25.14 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  27.14 
 
 
331 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  26.21 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  30.42 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  27.17 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  25.87 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  27.53 
 
 
331 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  28.71 
 
 
359 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  27.67 
 
 
322 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  27.89 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  24.43 
 
 
326 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  25 
 
 
372 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  27.71 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  25.93 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  26.55 
 
 
326 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  23.6 
 
 
330 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  25.14 
 
 
331 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  28.82 
 
 
337 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  24.22 
 
 
332 aa  106  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  24.37 
 
 
354 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  25.54 
 
 
364 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  28.21 
 
 
347 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  28.21 
 
 
347 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  25.84 
 
 
356 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  25 
 
 
338 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  26 
 
 
360 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  25 
 
 
335 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  26.74 
 
 
341 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  27.44 
 
 
368 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  26.33 
 
 
315 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  27.81 
 
 
336 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  25.95 
 
 
359 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  25.52 
 
 
381 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  24.93 
 
 
353 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  24.86 
 
 
331 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0791  adenosine deaminase  27.22 
 
 
336 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  25.34 
 
 
360 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  27.35 
 
 
332 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  22.38 
 
 
336 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  24.56 
 
 
317 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  24.5 
 
 
335 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  24.26 
 
 
317 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  24.15 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  25.28 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>