60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35058 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  100 
 
 		 672 aa  1391    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  31.53 
 
 		 304 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  31.74 
 
 		 318 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 309 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  31.01 
 
 		 297 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 297 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  28.88 
 
 		 350 aa  128  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  30.42 
 
 		 308 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 308 aa  126  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  28.53 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 317 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1084  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 316 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.29 
 
 		 309 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  29.85 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  30.33 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 309 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 309 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 297 aa  100  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0957  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 282 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00790982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0233  putative periplasmic substrate-binding protein  26.65 
 
 		 283 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45992  predicted protein  55.74 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.369476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  28.27 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  31.61 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.69 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  27.37 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  29.23 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35596  ABC(binding protein) family transporter: iron compound  27.27 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.076386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  27.18 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  29.32 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  27.04 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1910  hypothetical protein  54.76 
 
 		 60 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  30.05 
 
 		 261 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  27.08 
 
 		 244 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1010  hypothetical protein  61.29 
 
 		 66 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 270 aa  53.9  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 293 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 255 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.98 
 
 		 224 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 245 aa  51.2  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  23.96 
 
 		 222 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1413  hypothetical protein  62.5 
 
 		 72 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17109  hitchhiker  0.00000998425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 269 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  20.32 
 
 		 363 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  25.53 
 
 		 223 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6557  hypothetical protein  69.23 
 
 		 89 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0237  hypothetical protein  65.52 
 
 		 77 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1768  hypothetical protein  65.38 
 
 		 100 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00236113  normal  0.0541314 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3075  hypothetical protein  65.52 
 
 		 80 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000427586  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 293 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  22.89 
 
 		 270 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 258 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  30.77 
 
 		 226 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 328 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  26.2 
 
 		 213 aa  44.3  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  21.15 
 
 		 299 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>