32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35002 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  100 
 
 
302 aa  618  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  30.13 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44793  predicted protein  28.04 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  44.93 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30928  predicted protein  40 
 
 
169 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  28.69 
 
 
1048 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  26.5 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  36.61 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  26.83 
 
 
566 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54329  Putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase of the seven beta-strand family  24.88 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  hitchhiker  0.00259781 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09098  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
352 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000689737  normal  0.411917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  27.16 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  47.92 
 
 
669 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  41.54 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  40 
 
 
215 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  37.66 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  27.54 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 
235 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93639  predicted protein  30 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.252566 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29666  predicted protein  30 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.294797  normal  0.0130447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  31.78 
 
 
227 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02500  Putative nicotinamide N-methyltransferase (EC 2.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAD0]  27.6 
 
 
262 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00380138  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  27.03 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  25.75 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  29.25 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50590  predicted protein  23.62 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.495223 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32852  predicted protein  30.08 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  24.53 
 
 
240 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02210  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 
428 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0815555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  24.08 
 
 
237 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  34.92 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  38.46 
 
 
210 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>