16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34576 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  100 
 
 		 333 aa  695    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  62.28 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  27.05 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  26.72 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  25.89 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  23.28 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  24.39 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  25.56 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  25.56 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  22.74 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  23.5 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  21.93 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>