20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33730 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33730  predicted protein  100 
 
 
402 aa  837    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00194424  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33874  predicted protein  44.68 
 
 
269 aa  249  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33873  predicted protein  45.02 
 
 
314 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37228  predicted protein  76.47 
 
 
567 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42740  predicted protein  31.87 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181506  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44648  predicted protein  30.45 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43507  predicted protein  29.27 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44608  predicted protein  31.25 
 
 
1115 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43508  predicted protein  29.02 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50419  predicted protein  29.32 
 
 
345 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49062  predicted protein  25.99 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956342  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43397  predicted protein  25.93 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00959094  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48700  predicted protein  26.55 
 
 
509 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.877799  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44923  predicted protein  29.53 
 
 
723 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48696  predicted protein  24.08 
 
 
853 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49068  predicted protein  25.12 
 
 
1472 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34469  predicted protein  28.19 
 
 
464 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48701  predicted protein  25.29 
 
 
615 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48695  predicted protein  25.87 
 
 
972 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43395  predicted protein  24.81 
 
 
385 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>