More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3267 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  100 
 
 
304 aa  630  1e-180  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  47.04 
 
 
348 aa  228  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  45.25 
 
 
276 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  45.1 
 
 
279 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  43.79 
 
 
279 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  41.64 
 
 
288 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.34 
 
 
358 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  41.25 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  42.48 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.58 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.74 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.69 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  41.99 
 
 
280 aa  209  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  43.41 
 
 
283 aa  208  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  42.35 
 
 
279 aa  208  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  42.16 
 
 
285 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  39.14 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  37.75 
 
 
298 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33 
 
 
271 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  38.83 
 
 
303 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  36.66 
 
 
277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  36.66 
 
 
277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  42.49 
 
 
286 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  34.32 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  34.44 
 
 
284 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  36.09 
 
 
287 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  36.39 
 
 
286 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  37.21 
 
 
287 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  33.77 
 
 
284 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  35.74 
 
 
284 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  36.27 
 
 
280 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
280 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.66 
 
 
278 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  30.72 
 
 
364 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  34.21 
 
 
287 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  34.21 
 
 
287 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  35 
 
 
288 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.99 
 
 
391 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.12 
 
 
362 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.11 
 
 
393 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  38.63 
 
 
288 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  34.75 
 
 
284 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  36.75 
 
 
286 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  36.88 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  33.12 
 
 
276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.74 
 
 
355 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  30.07 
 
 
365 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  30.39 
 
 
364 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  30.39 
 
 
364 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  32.68 
 
 
392 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  33.11 
 
 
276 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  30.07 
 
 
367 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
380 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  30.07 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  30.07 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  34.1 
 
 
286 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  32.46 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  35.67 
 
 
293 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  30.07 
 
 
364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.74 
 
 
364 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  31.07 
 
 
274 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  34.65 
 
 
286 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.58 
 
 
632 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  32.47 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  32.24 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  31.91 
 
 
654 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  29.08 
 
 
365 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
392 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.15 
 
 
671 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.6 
 
 
659 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.59 
 
 
667 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.59 
 
 
667 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.59 
 
 
667 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  32.79 
 
 
659 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  31.58 
 
 
657 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  28.76 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.31 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  31.35 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  38.08 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  34.42 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.31 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  31.91 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  30.92 
 
 
662 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  31.82 
 
 
664 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  35.27 
 
 
265 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  31.82 
 
 
664 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  31.82 
 
 
664 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  31.82 
 
 
664 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  30.26 
 
 
648 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  37.18 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.06 
 
 
358 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  30.26 
 
 
373 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  31.15 
 
 
391 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  36.13 
 
 
275 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  32.9 
 
 
276 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  33.44 
 
 
297 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  30.26 
 
 
662 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  36.51 
 
 
277 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  34.1 
 
 
286 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>