91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32292 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  100 
 
 
502 aa  1033    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  33.41 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.43 
 
 
414 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  33.94 
 
 
432 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.49 
 
 
413 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  36.71 
 
 
413 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.67 
 
 
414 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  34.8 
 
 
432 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.82 
 
 
419 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.06 
 
 
407 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  35.29 
 
 
414 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  34.3 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  34.57 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  34.57 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.8 
 
 
416 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  32.5 
 
 
419 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  33.88 
 
 
419 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  34.31 
 
 
389 aa  190  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  32.68 
 
 
393 aa  186  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  35.01 
 
 
390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  32.24 
 
 
394 aa  183  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  32.46 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.85 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  33.73 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  34.89 
 
 
409 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.81 
 
 
389 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  32.3 
 
 
408 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  31.41 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  30.66 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  33.25 
 
 
388 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  33.09 
 
 
390 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 
410 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  34.24 
 
 
430 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  32.86 
 
 
419 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  32.79 
 
 
419 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  32.56 
 
 
419 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  32.56 
 
 
419 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.99 
 
 
389 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 
420 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  31.38 
 
 
421 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 
404 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.77 
 
 
386 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.5 
 
 
404 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  30.48 
 
 
406 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  31.04 
 
 
418 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  30.7 
 
 
421 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  28.06 
 
 
1506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  29.76 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  31.58 
 
 
388 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.02 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  29.12 
 
 
398 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.98 
 
 
402 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  29.54 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  31.57 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  30.23 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
427 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  36.05 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  30.12 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  37.58 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.25 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  30.05 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  29.44 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  31.21 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  29.71 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 
368 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  28 
 
 
377 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  25.23 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  25.23 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  25.23 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  24.87 
 
 
377 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 
350 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  27.83 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  31.16 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  26.67 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  27.04 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 
343 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  54.7  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  54.7  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  28.21 
 
 
352 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  27.21 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  27.21 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
365 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  27.96 
 
 
324 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  30.97 
 
 
348 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.89 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  29.5 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  25.51 
 
 
376 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  27.94 
 
 
343 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>