22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31877 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31877  predicted protein  100 
 
 
407 aa  850    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00010716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.55 
 
 
561 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.07 
 
 
570 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3924  signal peptide peptidase A  28.78 
 
 
682 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  25 
 
 
609 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  26.29 
 
 
569 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  25.36 
 
 
611 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25 
 
 
566 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.82 
 
 
589 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  25.34 
 
 
608 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.19 
 
 
595 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  21.56 
 
 
563 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.54 
 
 
593 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  28.24 
 
 
593 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.54 
 
 
593 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  25.56 
 
 
623 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.54 
 
 
593 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  22.86 
 
 
585 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.34 
 
 
656 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  23.66 
 
 
594 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  24.56 
 
 
609 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>