91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31109 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
520 aa  1060    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  44.44 
 
 
472 aa  333  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  38.24 
 
 
482 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  33.4 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  32.63 
 
 
495 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 
469 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 
469 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  32.63 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 
467 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  30.83 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  31.75 
 
 
446 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  31.75 
 
 
446 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  27.87 
 
 
441 aa  154  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 
469 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  27.18 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 
491 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 
473 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 
473 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 
473 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.02 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
473 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  29.87 
 
 
475 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  31.98 
 
 
476 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  26.38 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  27.81 
 
 
460 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.85 
 
 
479 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  28.83 
 
 
459 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  26.06 
 
 
474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  26.27 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  27.59 
 
 
509 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.78 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.28 
 
 
482 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 
454 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  27.48 
 
 
423 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  26.8 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  27.71 
 
 
473 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  22.96 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  22.96 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  23.94 
 
 
476 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  27.6 
 
 
488 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  27.23 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  24.27 
 
 
463 aa  86.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.99 
 
 
419 aa  73.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.17 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.55 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  22.96 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  22.96 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  22.32 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  22.88 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.61 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.55 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.92 
 
 
466 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 
466 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 
470 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.59 
 
 
466 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  22.89 
 
 
454 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.74 
 
 
473 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 
466 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  23.19 
 
 
470 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 
421 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  22.3 
 
 
424 aa  60.1  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  23.62 
 
 
479 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  24.76 
 
 
477 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  23.91 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  23.01 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 
460 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  23.52 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 
479 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03920  protoporphyrinogen oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08440)  22.36 
 
 
602 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.556614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 
469 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 
487 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  24.48 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  26.53 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  23.23 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.12 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  22.17 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  24.6 
 
 
783 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.57 
 
 
471 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>