More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30967 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30575  predicted protein  65.31 
 
 		 546 aa  659    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30967  predicted protein  100 
 
 		 539 aa  1109    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5912  ketol-acid reductoisomerase  32.87 
 
 		 347 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02480  ketol-acid reductoisomerase, putative  30.88 
 
 		 401 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2039  ketol-acid reductoisomerase  33.14 
 
 		 352 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.580971  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02526  acetohydroxyacid reductoisomerase (Eurofung)  31.77 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.210486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3679  ketol-acid reductoisomerase  33.53 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3478  ketol-acid reductoisomerase  32.52 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1923  ketol-acid reductoisomerase  34.38 
 
 		 347 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78299  mitochondrial ketol-acid reductoisomerase  29.1 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  37.1 
 
 		 331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  32.77 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  35.25 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  34.13 
 
 		 331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  37.25 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  31.96 
 
 		 336 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  32.63 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  34.93 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  32.28 
 
 		 338 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  29.36 
 
 		 338 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  34.01 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  36.24 
 
 		 359 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  30.49 
 
 		 338 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  35.53 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  35.53 
 
 		 338 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 335 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  37.28 
 
 		 333 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  32.94 
 
 		 329 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 338 aa  124  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  32.94 
 
 		 338 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  32.94 
 
 		 338 aa  124  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  35.37 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  35.37 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  32.98 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  38.33 
 
 		 330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  32.31 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  34.82 
 
 		 330 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  35.81 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  34.93 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  32.31 
 
 		 338 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  36.4 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  31.36 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  37.28 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  31.91 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  31.78 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  33.78 
 
 		 333 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  33.78 
 
 		 333 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  29.29 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  37.28 
 
 		 335 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  34.36 
 
 		 338 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  32.8 
 
 		 346 aa  120  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  31.47 
 
 		 338 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  31.82 
 
 		 338 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  31.78 
 
 		 338 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  35.83 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  34.01 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  31.4 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  33.19 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  28.62 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  32.56 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  31.8 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  31.4 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  33.87 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  34.98 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  32.03 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  31.41 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  39.11 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  31.78 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  36.24 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  29.59 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  36.24 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  35.81 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  36.68 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1848  ketol-acid reductoisomerase  34.25 
 
 		 340 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  32.16 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  32.28 
 
 		 335 aa  118  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  35.65 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  30.61 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  33.73 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  32.99 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  32.99 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  32.03 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 336 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0641  ketol-acid reductoisomerase  34.49 
 
 		 336 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.141252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  32.17 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1015  ketol-acid reductoisomerase  31.78 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>