27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30908 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  100 
 
 		 975 aa  2013    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  32.93 
 
 		 985 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  29.85 
 
 		 564 aa  227  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 1099 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  31.13 
 
 		 975 aa  194  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_19389  predicted protein  32.65 
 
 		 388 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000708555 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  40.26 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  28.06 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  29.49 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.66 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  25.21 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  28.89 
 
 		 938 aa  58.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  23.15 
 
 		 233 aa  55.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  21.4 
 
 		 769 aa  54.7  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  25.13 
 
 		 751 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  25 
 
 		 230 aa  52.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  25.13 
 
 		 749 aa  52.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  25.13 
 
 		 749 aa  51.6  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  43.64 
 
 		 829 aa  51.6  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  22.39 
 
 		 763 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  41.82 
 
 		 820 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  35 
 
 		 851 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  30.08 
 
 		 234 aa  47  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  30.68 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 215 aa  45.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>