14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3062 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_3062  predicted protein  100 
 
 
349 aa  729    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33631  predicted protein  49.71 
 
 
412 aa  333  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0827491  normal  0.813084 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10956  histone acetyltransferase catalytic subunit (Eurofung)  47.2 
 
 
508 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0558493  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03160  hypothetical protein  45.1 
 
 
564 aa  269  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51406  predicted protein  45.12 
 
 
297 aa  262  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34656  predicted protein  39.51 
 
 
417 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0290177  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82300  predicted protein  40 
 
 
516 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284716  normal  0.810962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05640  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10910)  43.01 
 
 
1068 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.814217  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  44.1 
 
 
940 aa  225  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42025  predicted protein  41.47 
 
 
458 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.067727  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50903  predicted protein  35.44 
 
 
553 aa  190  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03071  histone acetyltransferase (MysT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09610)  30.99 
 
 
363 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.605108 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00500  conserved hypothetical protein  39.2 
 
 
584 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29380  predicted protein  34.22 
 
 
357 aa  122  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000000817876  normal  0.405165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>