More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30585 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  100 
 
 		 942 aa  1927    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  42.79 
 
 		 1168 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1192 aa  495  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1153 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  42.41 
 
 		 1158 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  41.62 
 
 		 1188 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  40.85 
 
 		 1166 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  42.25 
 
 		 1158 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  40.28 
 
 		 1169 aa  486  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  40.79 
 
 		 1192 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  41.35 
 
 		 1193 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1170 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  43.03 
 
 		 1174 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  42.69 
 
 		 1169 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  40.06 
 
 		 1169 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1180 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.13 
 
 		 1165 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  43.27 
 
 		 1175 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  39 
 
 		 1167 aa  466  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  39 
 
 		 1167 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.98 
 
 		 1123 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1183 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  38.81 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.2 
 
 		 1178 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  38.81 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  39.1 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  38.66 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1169 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.66 
 
 		 1176 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1176 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  42.96 
 
 		 1244 aa  445  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  41.61 
 
 		 1170 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.63 
 
 		 1178 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  38.39 
 
 		 1141 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1112 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  41.65 
 
 		 1177 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.5 
 
 		 1177 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  40.45 
 
 		 1162 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1169 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1197 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  40.45 
 
 		 1162 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0409  transcription-repair coupling factor  40.8 
 
 		 1126 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1168 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1168 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1165 aa  432  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1155 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  37.46 
 
 		 1176 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0988  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1146 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1174 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  41.08 
 
 		 1183 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  46.19 
 
 		 1162 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  38.5 
 
 		 1197 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1246 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 		 893 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  39.32 
 
 		 1113 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1179 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  46.04 
 
 		 1207 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  39.7 
 
 		 1150 aa  426  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  40.17 
 
 		 1115 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  39.69 
 
 		 1196 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  39.15 
 
 		 893 aa  425  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  40.38 
 
 		 1112 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2039  transcription-repair coupling factor  38.83 
 
 		 1152 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  39.35 
 
 		 1126 aa  419  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  46.52 
 
 		 1265 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  39.38 
 
 		 1189 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1207 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  39.73 
 
 		 1121 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5808  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1351 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294236  normal  0.50078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  38.84 
 
 		 1153 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1123 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  38.64 
 
 		 1054 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  40.04 
 
 		 1073 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.9 
 
 		 974 aa  419  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  39.83 
 
 		 1165 aa  416  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  40.34 
 
 		 1155 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  40.51 
 
 		 1182 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1179 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1126 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  41.65 
 
 		 1179 aa  415  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  39.17 
 
 		 1109 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  40.41 
 
 		 1161 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  36.9 
 
 		 1122 aa  411  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1179 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  39.77 
 
 		 1198 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.58 
 
 		 923 aa  412  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  40.45 
 
 		 1153 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  39.27 
 
 		 1159 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  38.14 
 
 		 1174 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  40.45 
 
 		 1150 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  39.02 
 
 		 1182 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  37.6 
 
 		 1122 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2848  transcription-repair coupling factor  39.39 
 
 		 1164 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420758  normal  0.818462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  36.71 
 
 		 1188 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1177 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  37.09 
 
 		 1224 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>