139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3046 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  100 
 
 
314 aa  623  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  61.83 
 
 
266 aa  302  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  41.01 
 
 
334 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  40.2 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  41.78 
 
 
292 aa  215  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  42.05 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  42.02 
 
 
340 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  39.03 
 
 
314 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  40.2 
 
 
319 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  39.19 
 
 
311 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  39.22 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  38.36 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  37.67 
 
 
305 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  39.55 
 
 
313 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  39.55 
 
 
313 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  36.75 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 
322 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.8 
 
 
310 aa  165  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  35.43 
 
 
322 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  35.76 
 
 
322 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  35.69 
 
 
309 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  35.22 
 
 
319 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  35.1 
 
 
322 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  35.1 
 
 
322 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  35.1 
 
 
322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  35.43 
 
 
322 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  34.77 
 
 
322 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  33.67 
 
 
303 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  32.33 
 
 
321 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  41 
 
 
319 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  35.07 
 
 
318 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  33 
 
 
321 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  32.33 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  34.95 
 
 
344 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  36.09 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  34.95 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  34.55 
 
 
319 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 
308 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  37.16 
 
 
315 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  34.13 
 
 
300 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  33.79 
 
 
303 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  35.76 
 
 
318 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  35.97 
 
 
323 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  36.52 
 
 
303 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  38.26 
 
 
311 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  33.79 
 
 
303 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  33.79 
 
 
303 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  35.35 
 
 
309 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  34.9 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  35.37 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  37.32 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  35.35 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  34.11 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  34.11 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  37.5 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  34.03 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  34.52 
 
 
334 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  34.98 
 
 
326 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  34.47 
 
 
316 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  36.42 
 
 
336 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  31.77 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  36.03 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  36.49 
 
 
321 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  33.78 
 
 
351 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  35.06 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  35.11 
 
 
300 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  41.3 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  32.91 
 
 
336 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  32.7 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  32.99 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  38.62 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  36.13 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  32.03 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  32.75 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  29.81 
 
 
325 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  32.49 
 
 
333 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  38.72 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  33.99 
 
 
321 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  30.37 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  29.7 
 
 
350 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  31.68 
 
 
315 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  31.35 
 
 
315 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  29.66 
 
 
368 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  32.89 
 
 
324 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  25.85 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  28.63 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  28.9 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  27.02 
 
 
435 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  27.34 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  29.22 
 
 
297 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  26.22 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  25.2 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  24.71 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  25.93 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  29.39 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  26.32 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  26.86 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  26.45 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  26.45 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>