More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30145 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  980    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  56.09 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  56.51 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  52.78 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  57.39 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  52.79 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  51.04 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  51.04 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  50.81 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  51.17 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  48.95 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  52.31 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  49.88 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  49.18 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  49.08 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  49.18 
 
 		 440 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  49.42 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  47.93 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  48.03 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  48.15 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  49.07 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  44.88 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  26.64 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.19 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  29.7 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  29.6 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  30.32 
 
 		 432 aa  133  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  30.26 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  29.71 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  28.35 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  27.81 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  29.34 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  28 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.86 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  28.49 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.5 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  28.64 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  28.21 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  28.21 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  28.15 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  28.79 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  28.87 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  28.87 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  28.87 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  28.21 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  28.21 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  29.23 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  28.45 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  27.44 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  28.21 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  28.06 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  28.5 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  27.67 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  27.79 
 
 		 428 aa  123  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  27.67 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  27.67 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_002978  WD1151  citrate synthase  28.18 
 
 		 416 aa  123  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00353381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  28.72 
 
 		 428 aa  123  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  27.67 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  25.69 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.69 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  28.35 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.9 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  25.69 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  28.94 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  27.69 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  29.73 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  28.87 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  27.99 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  27.15 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  28.74 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  27.92 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  28.97 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.19 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  28 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  27.56 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.4 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.25 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  28.21 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  27.34 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  28.33 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  31.21 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  28.93 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  28.33 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  29.17 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  28.45 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>