146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30139 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  100 
 
 
207 aa  431  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  58 
 
 
206 aa  248  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  57.64 
 
 
205 aa  242  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  57.35 
 
 
211 aa  236  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  51.94 
 
 
207 aa  230  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  51.92 
 
 
205 aa  229  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  52.97 
 
 
203 aa  229  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  55.62 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  55.29 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  47.06 
 
 
208 aa  206  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  49.41 
 
 
208 aa  192  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  48 
 
 
203 aa  178  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  43.2 
 
 
213 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  42.79 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  43.6 
 
 
210 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  37.75 
 
 
214 aa  164  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  37.91 
 
 
220 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  38.89 
 
 
202 aa  156  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  42.59 
 
 
210 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  39.15 
 
 
229 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  37.37 
 
 
240 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  37.77 
 
 
205 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  40.22 
 
 
184 aa  141  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  40.12 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  34.63 
 
 
218 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  41.07 
 
 
207 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  42.33 
 
 
236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  35.56 
 
 
233 aa  135  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  39.39 
 
 
205 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  38.33 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  36.78 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  40.61 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  39.18 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  34.15 
 
 
224 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  31.65 
 
 
258 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  37.65 
 
 
214 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  37.06 
 
 
183 aa  121  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  37.06 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  34.87 
 
 
200 aa  118  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  40.15 
 
 
885 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  33.17 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  36.22 
 
 
237 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  36.09 
 
 
212 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  34.55 
 
 
212 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  43.48 
 
 
175 aa  102  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  35.88 
 
 
174 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  40.48 
 
 
307 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  29.63 
 
 
171 aa  98.6  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  30.1 
 
 
261 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  29.26 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  34.32 
 
 
178 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  32.72 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  29.58 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  33.72 
 
 
230 aa  92  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  33.72 
 
 
225 aa  91.3  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  28.07 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  29.89 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  29.7 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  30.05 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  37.5 
 
 
175 aa  88.2  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  29.84 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  37.31 
 
 
358 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  32.53 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  29.13 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  28.83 
 
 
176 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  32.1 
 
 
159 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  32.79 
 
 
187 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  26.9 
 
 
220 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.51 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  28.92 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  26.71 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  27.04 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  29.71 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  29.14 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  28.65 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  27.48 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  27.68 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  34.97 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  29.73 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.14 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  26.82 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.75 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  28.34 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  28.07 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  32.76 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  27.38 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.07 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  31.25 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  26.09 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  31.13 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  27.85 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  23.94 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  26.92 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  26.37 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
167 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  29.27 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  26.51 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  31.25 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  32.37 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  27.84 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>