More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29861 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_29861  predicted protein  100 
 
 
390 aa  808    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.903931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.35 
 
 
300 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
298 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 
300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.33 
 
 
304 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.44 
 
 
300 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.19 
 
 
304 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.27 
 
 
298 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.29 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.87 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 
300 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.35 
 
 
300 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.85 
 
 
295 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.23 
 
 
296 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 
296 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.6 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.79 
 
 
300 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.8 
 
 
300 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
302 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.29 
 
 
506 aa  137  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.29 
 
 
328 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.92 
 
 
299 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.56 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.21 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.63 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.66 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3351  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.54 
 
 
301 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 
294 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 
293 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.82 
 
 
293 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.75 
 
 
292 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.52 
 
 
307 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
298 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.87 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  30.15 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.65 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.48 
 
 
297 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.02 
 
 
292 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.34 
 
 
293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.76 
 
 
300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.48 
 
 
297 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.06 
 
 
292 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.65 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.15 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.69 
 
 
296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.44 
 
 
292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.03 
 
 
293 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.3 
 
 
298 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.32 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.15 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.72 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  29 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.97 
 
 
295 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  31.37 
 
 
311 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.69 
 
 
295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.11 
 
 
290 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.8 
 
 
301 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.97 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.75 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 
308 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 
295 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.67 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1047  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.34 
 
 
293 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.32 
 
 
295 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.51 
 
 
307 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.01 
 
 
303 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.88 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.5 
 
 
293 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.9 
 
 
295 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.7 
 
 
308 aa  106  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.04 
 
 
285 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.05 
 
 
298 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.65 
 
 
293 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.92 
 
 
294 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>