27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29736 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  40.33 
 
 
279 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  37.04 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  33.47 
 
 
302 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  34.29 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  33.47 
 
 
302 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  32.81 
 
 
301 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  33.46 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  31.97 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  32.11 
 
 
294 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  31.97 
 
 
297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  31.15 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  33.33 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  33.61 
 
 
293 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  32.24 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  32.93 
 
 
297 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  32.24 
 
 
293 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  31.05 
 
 
301 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  31.98 
 
 
289 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  30.61 
 
 
314 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  29.96 
 
 
299 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  30.49 
 
 
298 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  30.61 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  29.8 
 
 
292 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  27.87 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  30.53 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  27.87 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>