41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29381 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  100 
 
 		 329 aa  688    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  35.69 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.42 
 
 		 275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  34.98 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  36.71 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  30.54 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  32.19 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  30.32 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  27.41 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  29 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.41 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.39 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.86 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.45 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.54 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.04 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.71 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.89 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  30.7 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  27.1 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  26 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.84 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.47 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.33 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.68 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.9 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>