216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29217 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29217  predicted protein  100 
 
 
406 aa  834    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28526  predicted protein  36.97 
 
 
379 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00750  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 
388 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.335958  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67940  Curved DNA-binding protein (42 kDa protein)  30.87 
 
 
383 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07299  curved DNA-binding protein (42 kDa protein) (AFU_orthologue; AFUA_2G16820)  27.27 
 
 
403 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336171  normal  0.145965 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04404  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00410)  24.12 
 
 
448 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2126  methionine aminopeptidase  25.32 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.110507  normal  0.0130853 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00369  methionine aminopeptidase, type II, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01750)  24.93 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285783  normal  0.444131 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0689  methionine aminopeptidase  25.37 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.827876  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0134  methionine aminopeptidase  25.85 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0755  methionine aminopeptidase  25.17 
 
 
295 aa  89.7  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1229  methionine aminopeptidase  25.54 
 
 
299 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2090  methionine aminopeptidase  24.68 
 
 
293 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2339  methionine aminopeptidase  28.93 
 
 
291 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0487  methionine aminopeptidase  25 
 
 
294 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0165  methionine aminopeptidase  25.07 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00223566  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0601  methionine aminopeptidase  25.9 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1074  methionine aminopeptidase, type II  26.51 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0688841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2584  methionine aminopeptidase  22.66 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1051  methionine aminopeptidase  23.99 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0178162 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17304  predicted protein  24.18 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.052839  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02860  hypothetical protein  23.84 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0680  methionine aminopeptidase  27.72 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1322  methionine aminopeptidase  26.15 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0870  methionine aminopeptidase  24.03 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1620  methionine aminopeptidase  26.62 
 
 
297 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0959  methionine aminopeptidase  25.15 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1267  methionine aminopeptidase  25.38 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.531507 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65920  predicted protein  23.45 
 
 
576 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0754  methionine aminopeptidase, type II  25.17 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.326379  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48274  predicted protein  23.94 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2942  methionine aminopeptidase, type II  20.88 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1509  methionine aminopeptidase  25.09 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0549  methionine aminopeptidase, type II  21.79 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1013  methionine aminopeptidase  25.16 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.300955  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31342  predicted protein  21.35 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0071  methionine aminopeptidase  22.51 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0656  methionine aminopeptidase  23.38 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.220482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2052  methionine aminopeptidase  25.61 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
260 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  27.22 
 
 
248 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  24.18 
 
 
303 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  23.11 
 
 
253 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1316  methionine aminopeptidase  24.17 
 
 
296 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  24.33 
 
 
281 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  24.43 
 
 
260 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  26.32 
 
 
249 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  22.77 
 
 
254 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  24.38 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  23.86 
 
 
260 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1756  methionine aminopeptidase  28.02 
 
 
252 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0318499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  22.97 
 
 
254 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  24.44 
 
 
279 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  23.32 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  23.32 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  26.83 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  25.28 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  24.1 
 
 
255 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  23.31 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1766  methionine aminopeptidase, type I  32.79 
 
 
272 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0700  methionine aminopeptidase  28.28 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
252 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  22.08 
 
 
270 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  30.65 
 
 
255 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  26.67 
 
 
281 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  23.79 
 
 
250 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  23.18 
 
 
254 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0054  methionine aminopeptidase  27.62 
 
 
252 aa  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  26.14 
 
 
249 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  21.19 
 
 
252 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  23.11 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  25.44 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  27.78 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  22.52 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  23.44 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  25.39 
 
 
250 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  28.57 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  23.11 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  28.06 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  23.62 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  23.32 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  26.11 
 
 
247 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  25.84 
 
 
254 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  22.53 
 
 
275 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  32.43 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  23.46 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  24.34 
 
 
250 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  25.56 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  30 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  30 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  26.86 
 
 
270 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  21.86 
 
 
257 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  25.13 
 
 
253 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  25 
 
 
250 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  23.96 
 
 
256 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  25.71 
 
 
250 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  24.62 
 
 
253 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  24.62 
 
 
253 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  23.36 
 
 
259 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  38.27 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>