17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29174 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  100 
 
 		 544 aa  1124    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46552  predicted protein  59.85 
 
 		 525 aa  613  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105236  normal  0.308215 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02142  Karyopherin alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X175]  56.93 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.613304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04770  Importin alpha subunit, putative  56.64 
 
 		 536 aa  551  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  50.28 
 
 		 544 aa  506  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22319  predicted protein  38.79 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1457  predicted protein  40.88 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_5467  predicted protein  42.19 
 
 		 190 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000081806  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  26.44 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  25.08 
 
 		 579 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  25.69 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  27.98 
 
 		 1820 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  26.38 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.33 
 
 		 1148 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27814  predicted protein  24.7 
 
 		 1546 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.208046  normal  0.12178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.24 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1094 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>