44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29136 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  80.75 
 
 		 375 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  79.73 
 
 		 376 aa  657    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  79.31 
 
 		 377 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  100 
 
 		 377 aa  785    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  98.94 
 
 		 377 aa  778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  80.64 
 
 		 377 aa  667    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  98.94 
 
 		 377 aa  778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  54.18 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  52.72 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  48.39 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  45.04 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  44.13 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  45.21 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  44.15 
 
 		 388 aa  345  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  42.46 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  37.83 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  37.9 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  35.1 
 
 		 438 aa  255  8e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  35.78 
 
 		 416 aa  249  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  34.28 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  35.5 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  29.68 
 
 		 476 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  28.72 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  27.31 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  25.11 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  25.48 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  25.34 
 
 		 503 aa  122  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  26.23 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.48 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.19 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  25.71 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  25.29 
 
 		 770 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  23.57 
 
 		 775 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  36.7 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.06 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  20.89 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  23.24 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  30 
 
 		 667 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  23.08 
 
 		 779 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2620  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  20.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1635  actin/actin family protein  23.12 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27704  predicted protein  74.07 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.277976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  20 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  21.57 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>