266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29097 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  75.66 
 
 		 194 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  72.34 
 
 		 215 aa  295  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  71.43 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  67.55 
 
 		 205 aa  279  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  47.76 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  52.38 
 
 		 193 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  48.94 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  47.87 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  48.4 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  47.31 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  49.21 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  44.55 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  46.84 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  45.79 
 
 		 188 aa  168  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  45.79 
 
 		 188 aa  168  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  43.09 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  44.21 
 
 		 188 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  44.39 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  40.96 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  41.4 
 
 		 197 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  44.09 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  41.58 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  38.5 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  40.31 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  40.32 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  36.79 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  38.97 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  40 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  37.63 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  40.21 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  38.3 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  41.4 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  36.29 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  37.4 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  36.8 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  36 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0334  30S ribosomal protein S7  36 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  34.68 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  37.1 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  36.29 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  34.4 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  36.29 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4919  30S ribosomal protein S7  36 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  36.29 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  35.48 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  33.87 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  35.48 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  33.6 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  34.68 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  35.71 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  34.68 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  31.25 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  32.52 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  33.87 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  34.96 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3799  30S ribosomal protein S7  35.2 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000156972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  31.69 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  34.15 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>