34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29011 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  100 
 
 
170 aa  327  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  100 
 
 
170 aa  327  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  67.88 
 
 
190 aa  202  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  70.97 
 
 
159 aa  203  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  60.47 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  60.24 
 
 
164 aa  189  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  58.54 
 
 
162 aa  184  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  62.26 
 
 
161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  53.76 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  57.14 
 
 
168 aa  173  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  59.12 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  55.84 
 
 
163 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  46.11 
 
 
189 aa  150  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16442  predicted protein  57.99 
 
 
168 aa  150  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.746613  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  52.98 
 
 
237 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  45.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  57.39 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  56.19 
 
 
151 aa  97.8  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  35.48 
 
 
211 aa  90.9  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  34.18 
 
 
196 aa  90.9  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  33.56 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  32.05 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23706  predicted protein  31.97 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0031909  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  27.33 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02380  hydrogen-transporting ATPase, putative  36.11 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  34.29 
 
 
151 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  34.38 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  34.38 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  34.38 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  31.37 
 
 
223 aa  41.6  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  23.49 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  32.35 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  32.35 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  32.35 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>