49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28794 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  100 
 
 
818 aa  1704    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  36.27 
 
 
842 aa  539  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  34.74 
 
 
849 aa  483  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  32.53 
 
 
852 aa  465  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  33.13 
 
 
791 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  29.11 
 
 
947 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
782 aa  334  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.4 
 
 
649 aa  73.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.65 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  23.16 
 
 
705 aa  70.5  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.18 
 
 
618 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.77 
 
 
674 aa  61.2  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.16 
 
 
643 aa  60.1  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  30.43 
 
 
658 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.04 
 
 
458 aa  58.2  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  37.93 
 
 
674 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.54 
 
 
835 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.55 
 
 
658 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.85 
 
 
628 aa  55.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  32.41 
 
 
686 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  32.41 
 
 
686 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.7 
 
 
749 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  28.43 
 
 
655 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  32.41 
 
 
689 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  25 
 
 
653 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  30.56 
 
 
689 aa  52.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  37.11 
 
 
726 aa  52.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.06 
 
 
699 aa  52  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  34.23 
 
 
469 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.41 
 
 
943 aa  51.2  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.9 
 
 
676 aa  51.2  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.44 
 
 
695 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  35 
 
 
663 aa  49.3  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.19 
 
 
651 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.57 
 
 
637 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  34.34 
 
 
680 aa  48.9  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.71 
 
 
638 aa  48.5  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  20.96 
 
 
646 aa  48.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  26.88 
 
 
646 aa  48.1  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  34.86 
 
 
625 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.76 
 
 
733 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  29.17 
 
 
644 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.21 
 
 
712 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.63 
 
 
623 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  25.49 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  22.28 
 
 
661 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  35.19 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.28 
 
 
765 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  27.38 
 
 
649 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>