59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28743 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_28743  predicted protein  100 
 
 		 203 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00180  histone lysine N-methyltransferase, putative  32.05 
 
 		 424 aa  82.4  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62019  member of Set1p complex, histone methyl transferase  24.27 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.805326 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12699  predicted protein  34.23 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00642034  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00065  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12370)  25.14 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 1221 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 		 1686 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9860  predicted protein  36 
 
 		 318 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.31 
 
 		 589 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1196 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.55 
 
 		 1247 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 		 1213 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.54 
 
 		 677 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65683  U3 snoRNP protein  31.82 
 
 		 951 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46295  predicted protein  29.41 
 
 		 670 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.723496  normal  0.226061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.43 
 
 		 1823 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.21 
 
 		 1330 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  31.91 
 
 		 612 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 		 1190 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.05 
 
 		 1357 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1190 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.85 
 
 		 676 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  35.85 
 
 		 522 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.4 
 
 		 1163 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  34.62 
 
 		 1411 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1214 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.2 
 
 		 1557 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1714 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  27.27 
 
 		 522 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 		 1711 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.84 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.41 
 
 		 642 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  31.46 
 
 		 935 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2346  WD40 repeat, subgroup  32.31 
 
 		 512 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.881407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 1760 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5898  WD-40 repeat protein  23.02 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.675112 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  25.86 
 
 		 359 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27 
 
 		 1363 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  24.03 
 
 		 389 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  35.71 
 
 		 884 aa  42.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07704  polyubiquitin binding protein (Doa1/Ufd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08370)  30.14 
 
 		 811 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00597659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02030  conserved hypothetical protein  42.5 
 
 		 665 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0945136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 		 344 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  22.22 
 
 		 473 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1247 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1474 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  20.74 
 
 		 1211 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 342 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53294  Hypothetical WD-40 repeat protein  41.07 
 
 		 1117 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.82 
 
 		 316 aa  42  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1661 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 		 589 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 		 947 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.74 
 
 		 1205 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.81 
 
 		 576 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  22.64 
 
 		 316 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>