21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28684 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  100 
 
 		 474 aa  988    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  36.45 
 
 		 616 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01280  conserved hypothetical protein  35.12 
 
 		 562 aa  299  9e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  35.78 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61453  ubiquitin specific protease  32.35 
 
 		 489 aa  240  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.483859 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  22.22 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  23.8 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  35.66 
 
 		 1418 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  24.47 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  28.47 
 
 		 1490 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  23.51 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  25.38 
 
 		 688 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  25.4 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.84 
 
 		 701 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  30.95 
 
 		 1340 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  22.91 
 
 		 1312 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  31.01 
 
 		 1075 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  32.61 
 
 		 1183 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  25.34 
 
 		 311 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  23.56 
 
 		 848 aa  46.6  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  24.29 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>