More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28585 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_28585  predicted protein  100 
 
 		 326 aa  671    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.663104  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41496  predicted protein  93.89 
 
 		 137 aa  256  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  41.82 
 
 		 336 aa  198  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  38.01 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32849  predicted protein  38.2 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  36.48 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  37.64 
 
 		 370 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  36.48 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  31.97 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  36.13 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  34.8 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  37.36 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.73 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  33.82 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  37.36 
 
 		 375 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  31.73 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  31.99 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  35.51 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  32.47 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  35.9 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  34.35 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  35.51 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  35.41 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  32.6 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  37.36 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  31.85 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  35.84 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  35.27 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  34.8 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  29.11 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  33.95 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  32.22 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  31.94 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  35.9 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  34.3 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  32.47 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  31.73 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  32.1 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  34.3 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  32.96 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  33.82 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.85 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  33.82 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  32.36 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  34.6 
 
 		 437 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  33.82 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>