114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28562 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  59.09 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  60.13 
 
 		 153 aa  187  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  61.15 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  56.67 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  43.64 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  40 
 
 		 108 aa  97.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  40 
 
 		 108 aa  97.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  39.45 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  43.52 
 
 		 106 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  40.91 
 
 		 109 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  40.57 
 
 		 109 aa  95.5  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  39.45 
 
 		 108 aa  94.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  42.73 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  41.9 
 
 		 108 aa  91.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  39.62 
 
 		 109 aa  90.9  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  40.19 
 
 		 108 aa  88.6  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  39.62 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  39.62 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  39.62 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  40.74 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  39.08 
 
 		 114 aa  85.1  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  44.76 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  43.18 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  36.28 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  34.86 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  37.04 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  38.68 
 
 		 114 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  36.04 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  35.14 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  34.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  35.51 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  33.64 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 86 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 86 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  39.74 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  38.55 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  39.51 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 82 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  43.06 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_002620  TC0806  30S ribosomal protein S17  36.76 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00619499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  42.11 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  41.89 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  40.58 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  38.57 
 
 		 89 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  37.04 
 
 		 82 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  39.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  41.89 
 
 		 83 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 84 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 84 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  30.86 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  37.84 
 
 		 79 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  37.66 
 
 		 88 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0442  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 88 aa  44.7  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00168249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  31.52 
 
 		 91 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  31.52 
 
 		 91 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  36.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  35 
 
 		 86 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  35.14 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  31.65 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  27.71 
 
 		 87 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  34.57 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  34.57 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  35.14 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  34.57 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  32.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  35 
 
 		 82 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  33.33 
 
 		 83 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  38.46 
 
 		 78 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  35.62 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>