73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28433 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  100 
 
 
167 aa  347  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  62.65 
 
 
165 aa  223  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  52.44 
 
 
166 aa  179  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  52.41 
 
 
209 aa  177  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  51.27 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  47.2 
 
 
175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  44.52 
 
 
167 aa  148  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  44.72 
 
 
225 aa  136  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  42.01 
 
 
242 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  36.2 
 
 
149 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  35.54 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  38.58 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  36.81 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  31.82 
 
 
147 aa  106  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  35.33 
 
 
169 aa  104  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  36.09 
 
 
160 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  29.87 
 
 
147 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  28.48 
 
 
149 aa  99  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  29.22 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  35.61 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  31.79 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  34.13 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
260 aa  91.7  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  29.87 
 
 
147 aa  91.3  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  31.52 
 
 
152 aa  90.5  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  28.4 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
134 aa  88.6  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  88.2  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  30 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  26.62 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  30.77 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  30.67 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  84  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  34.65 
 
 
137 aa  84  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  29.69 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  29.22 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  32.06 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  26.67 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  31.08 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  30.56 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  24.67 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  26.21 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  25.16 
 
 
220 aa  73.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  32.56 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  28.03 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  27.78 
 
 
470 aa  71.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  28.06 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10324  NEDD8 conjugating enzyme (UbcL), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14430)  29.66 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315281  normal  0.17789 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  25.95 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  29.61 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  26.23 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  27.05 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  25.36 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  26.02 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  27.44 
 
 
355 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  30.3 
 
 
246 aa  62  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07577  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15040)  27.81 
 
 
449 aa  61.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116566  normal  0.884772 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  26.36 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00500  hypothetical protein  27.4 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  27.27 
 
 
334 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  27.78 
 
 
277 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37077  predicted protein  27.27 
 
 
222 aa  51.2  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03136  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13060)  34.34 
 
 
1070 aa  50.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.460708  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01270  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
920 aa  47.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  27.27 
 
 
245 aa  47.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  25.2 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20308  predicted protein  30.7 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0878511  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05830  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
927 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00168148  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48883  predicted protein  32.98 
 
 
414 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10549  predicted protein  22.22 
 
 
111 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000151978  normal  0.856804 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02130  ubiquitin-conjugating enzyme E2-28.4KD, putative  28.57 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36882  predicted protein  31.31 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>