More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27956 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  100 
 
 		 634 aa  1316    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  57.09 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  55.47 
 
 		 540 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  55.64 
 
 		 539 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  55.64 
 
 		 539 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  53.74 
 
 		 548 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  54.53 
 
 		 556 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  54.98 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  55.19 
 
 		 555 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  54.17 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  55.19 
 
 		 555 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  54.91 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  54.04 
 
 		 563 aa  589  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  54.72 
 
 		 545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  53.43 
 
 		 545 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  54.73 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  54.72 
 
 		 545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  54.34 
 
 		 545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  54.36 
 
 		 571 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  45.73 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  45.73 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  45.14 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  42.69 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  47.96 
 
 		 543 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  46.33 
 
 		 528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 542 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  45.24 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  44.95 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  42.46 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  45.05 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  42.46 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  44.49 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  41.9 
 
 		 520 aa  459  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  42.96 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  46.97 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  45.97 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  44.42 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  46.34 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  44.08 
 
 		 527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  45.2 
 
 		 541 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  46.47 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  45.79 
 
 		 541 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  48.66 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  45.2 
 
 		 541 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  45.86 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  47.23 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  46.25 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 528 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.15 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  48.14 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  45.68 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  44.89 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  45.18 
 
 		 528 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  47.42 
 
 		 529 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  47.42 
 
 		 529 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  47.42 
 
 		 529 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  47.42 
 
 		 529 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  44.27 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  45.83 
 
 		 526 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  45.93 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  46.68 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  47.42 
 
 		 529 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  47.43 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  42.36 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  47.02 
 
 		 526 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  46.25 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  47.02 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  43.61 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  46.6 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  43.65 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  47.83 
 
 		 527 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  47.03 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  46.41 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  47.13 
 
 		 526 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  43.16 
 
 		 523 aa  439  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  47.25 
 
 		 526 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  46.95 
 
 		 529 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  46.06 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  47.93 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  46.6 
 
 		 529 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  46.6 
 
 		 529 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  46.47 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  46.63 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  45.9 
 
 		 526 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  47.34 
 
 		 523 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>