More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27659 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_27659  predicted protein  100 
 
 		 157 aa  316  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  55.83 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  56.64 
 
 		 137 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  55.75 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  48.91 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  49.18 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  51.33 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  46.1 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  50.39 
 
 		 132 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  49.24 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  51.79 
 
 		 184 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  47.11 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0657  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0531891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 127 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  50.44 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  48.33 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  48.76 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.17 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  48.33 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  51.75 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>