More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26980 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1116    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  58.51 
 
 
553 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  58.06 
 
 
542 aa  623  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  58.35 
 
 
558 aa  617  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  55.09 
 
 
568 aa  588  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  39.07 
 
 
553 aa  365  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  39.18 
 
 
545 aa  360  5e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  39.12 
 
 
543 aa  350  6e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  39.07 
 
 
543 aa  349  7e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  39.7 
 
 
560 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  37.64 
 
 
551 aa  348  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  38.5 
 
 
555 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  38.92 
 
 
543 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  36.92 
 
 
557 aa  341  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.11 
 
 
558 aa  339  9e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  38.66 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  37.94 
 
 
539 aa  335  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  37.45 
 
 
540 aa  334  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  37.06 
 
 
542 aa  333  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  37.29 
 
 
545 aa  329  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  37.34 
 
 
563 aa  329  8e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  36.72 
 
 
542 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  37.03 
 
 
554 aa  324  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  36.84 
 
 
553 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  36.72 
 
 
542 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  37.1 
 
 
543 aa  324  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  37.27 
 
 
554 aa  322  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  37.8 
 
 
548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  36.89 
 
 
560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.39 
 
 
551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  37.52 
 
 
559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  37.66 
 
 
558 aa  319  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  36.7 
 
 
558 aa  319  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  36.12 
 
 
570 aa  318  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  36.72 
 
 
559 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  38.73 
 
 
550 aa  318  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  37.02 
 
 
562 aa  318  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  37.73 
 
 
547 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  38.48 
 
 
552 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  38.1 
 
 
551 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  37.59 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  36.53 
 
 
557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  37.8 
 
 
554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  37.48 
 
 
577 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  37.55 
 
 
549 aa  312  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  37.68 
 
 
553 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  37.83 
 
 
552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  37.17 
 
 
553 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.81 
 
 
542 aa  303  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  37.48 
 
 
558 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  37.36 
 
 
552 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  35.38 
 
 
547 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  35.44 
 
 
554 aa  296  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  35.45 
 
 
563 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  36.06 
 
 
560 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  36.71 
 
 
530 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  35.76 
 
 
561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  36.42 
 
 
535 aa  289  9e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.64 
 
 
555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  35.48 
 
 
500 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.83 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.51 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.9 
 
 
546 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  34.64 
 
 
548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.27 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.2 
 
 
532 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.84 
 
 
530 aa  273  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  34.26 
 
 
523 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  33.02 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.84 
 
 
527 aa  267  5e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  33.7 
 
 
536 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  36.06 
 
 
527 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.64 
 
 
519 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.76 
 
 
531 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.98 
 
 
529 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  31.14 
 
 
538 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.21 
 
 
525 aa  260  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  34.33 
 
 
550 aa  260  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  32.27 
 
 
527 aa  260  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.55 
 
 
525 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.37 
 
 
526 aa  258  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  33.64 
 
 
535 aa  256  7e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.09 
 
 
528 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  32.47 
 
 
553 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  30.55 
 
 
567 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  32.47 
 
 
553 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  32.84 
 
 
536 aa  248  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  31.88 
 
 
541 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  33.27 
 
 
548 aa  246  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  33.71 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  32.2 
 
 
527 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  30.25 
 
 
559 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  31.84 
 
 
533 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.73 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  29.21 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  27.72 
 
 
541 aa  203  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  29.98 
 
 
549 aa  192  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  29.51 
 
 
529 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.33 
 
 
558 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  28.47 
 
 
581 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>