15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26802 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_26802  histone H2A isoform 3b  100 
 
 
126 aa  249  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34798  histone H2A isoform 3a  100 
 
 
126 aa  249  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476071  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46020  histone H2A isoform 2  91.96 
 
 
138 aa  209  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13104  predicted protein  84.11 
 
 
121 aa  191  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332383 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37161  predicted protein  75.2 
 
 
131 aa  188  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990123  normal  0.458805 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12803  predicted protein  83.18 
 
 
121 aa  187  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.349541 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13304  predicted protein  82.69 
 
 
129 aa  184  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604396  normal  0.477669 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73490  predicted protein  74.02 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0660566  normal  0.216039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03468  Histone H2A [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08844]  76.64 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503847  hitchhiker  0.000000000000165024 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00550  histone H2A-1, putative  72.95 
 
 
131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.331035  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_9318  predicted protein  58.97 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373768  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119619  predicted protein  53.85 
 
 
143 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505644  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04080  histone h2a variant, putative  58.88 
 
 
138 aa  120  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28445  histone H2A isoform 1  56.19 
 
 
138 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.320484  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08039  Histone H2A.Z [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUJ1]  57.41 
 
 
136 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.68736  normal  0.469515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>