96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26515 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  100 
 
 		 272 aa  569  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  56.9 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  50.36 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  57.89 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  47.31 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  46.19 
 
 		 251 aa  215  8e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.22 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  39.08 
 
 		 689 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  41.3 
 
 		 689 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  42.68 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  43.02 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  42.86 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  42.35 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  43.72 
 
 		 688 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  41.57 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  41.26 
 
 		 688 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  41.32 
 
 		 690 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  40.43 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  40 
 
 		 688 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  40.57 
 
 		 687 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.34 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  39.3 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  40.26 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  35.96 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  43.78 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  43.78 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  38.18 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  42.23 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  37.65 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  39.41 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  40.62 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  41.45 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  38.24 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  37.76 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  37.3 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  43.56 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  37.31 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  37.31 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  38.98 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  37.97 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  37.63 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  32.86 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  37.65 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  34.55 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  29.55 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  33.07 
 
 		 450 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  30.27 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  30.29 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  30.29 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  23.98 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  23.98 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  23.53 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  23.53 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.04 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.01 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  23.39 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  23.85 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  28.06 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  23.85 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  23.45 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.04 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  26.34 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  24.2 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  23.64 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  23.87 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.86 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  23.53 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.07 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  23.36 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  25.98 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  22.95 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  24.56 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  23.71 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  23.36 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  24.68 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  22.27 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  25.24 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  22.61 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  23.61 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  27.98 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  28.18 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  27.07 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  21.83 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  26.29 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0794  cytochrome c1  25.14 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0108816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.57 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  24.59 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  20.92 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  22.08 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  28.8 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>