More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_25127 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  54.67 
 
 
152 aa  193  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  57.62 
 
 
152 aa  192  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  56 
 
 
153 aa  190  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  55.78 
 
 
150 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  56.46 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
152 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  54.73 
 
 
149 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
151 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  52.03 
 
 
149 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  51.35 
 
 
151 aa  178  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  54.05 
 
 
149 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  52.7 
 
 
152 aa  175  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 
151 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 
151 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  50.34 
 
 
149 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  52.9 
 
 
151 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00491  nucleoside diphosphate kinase  55.22 
 
 
152 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  54 
 
 
155 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00531  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 
152 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  49.32 
 
 
149 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00471  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
152 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.602397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 
151 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0047  nucleoside diphosphate kinase  54.48 
 
 
152 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
149 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  53.03 
 
 
149 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  49.31 
 
 
152 aa  165  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  53.85 
 
 
149 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  48.65 
 
 
150 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  45.95 
 
 
149 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  48.65 
 
 
149 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  51.97 
 
 
159 aa  161  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  50.66 
 
 
160 aa  161  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  48.3 
 
 
148 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  47.62 
 
 
148 aa  158  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  46.94 
 
 
166 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 
149 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  49.32 
 
 
151 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 
149 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 
154 aa  153  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  45.07 
 
 
143 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  49.62 
 
 
154 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 
149 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  49.65 
 
 
144 aa  151  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  46.62 
 
 
149 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  46.62 
 
 
149 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  44.59 
 
 
149 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 
149 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  44.37 
 
 
143 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  48.46 
 
 
139 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  45.95 
 
 
149 aa  148  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0718  nucleoside diphosphate kinase  47.97 
 
 
149 aa  147  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0214366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  43.92 
 
 
149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  46.15 
 
 
149 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 
136 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  48.12 
 
 
136 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  46.62 
 
 
136 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  48.48 
 
 
149 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  43.61 
 
 
139 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  48 
 
 
151 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  46.92 
 
 
135 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  47.69 
 
 
138 aa  141  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  44.36 
 
 
137 aa  141  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 
138 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  46.97 
 
 
135 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  45.19 
 
 
138 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  44.27 
 
 
137 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  43.94 
 
 
150 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  46.62 
 
 
136 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  43.94 
 
 
134 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  50 
 
 
143 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  46.97 
 
 
138 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  45.45 
 
 
142 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  44.03 
 
 
148 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  45.45 
 
 
142 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  46.21 
 
 
142 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  45.45 
 
 
136 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1571  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 
137 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  46.97 
 
 
136 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0716  nucleoside diphosphate kinase  45.86 
 
 
136 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0687  nucleoside diphosphate kinase  43.24 
 
 
150 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.36763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  46.1 
 
 
152 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  39.86 
 
 
149 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  46.27 
 
 
145 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  47.37 
 
 
141 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  45.45 
 
 
135 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  46.92 
 
 
141 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  44.27 
 
 
140 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  46.21 
 
 
136 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  47.06 
 
 
137 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  43.88 
 
 
147 aa  131  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  43.51 
 
 
149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>