More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24820 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  60.42 
 
 		 546 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24820  mitochondria-targeted chaperonin  100 
 
 		 579 aa  1157    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 549 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 542 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  61.19 
 
 		 546 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 540 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 542 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 545 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  61.01 
 
 		 549 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  59.25 
 
 		 551 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.77 
 
 		 543 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  60.56 
 
 		 548 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 542 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 545 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 545 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 547 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 542 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25997  chaperonin 60, mitochondrial  64.7 
 
 		 584 aa  718    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 550 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  60.96 
 
 		 543 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 545 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 547 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 539 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 544 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.3 
 
 		 542 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 547 aa  652    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 547 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.33 
 
 		 542 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  59.37 
 
 		 540 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 548 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 546 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 540 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 545 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  59.33 
 
 		 550 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 547 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60 
 
 		 547 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5830  chaperonin GroEL  59.09 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3427  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 540 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  58.77 
 
 		 549 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0795  chaperonin GroEL  59.33 
 
 		 547 aa  631  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  58.58 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  59.09 
 
 		 547 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  58.77 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  59.25 
 
 		 547 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3081  chaperonin GroEL  59.22 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  59.28 
 
 		 548 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90190  predicted protein  59.27 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.419732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0515  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 547 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 551 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  58.66 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7830  chaperonin GroEL  58.9 
 
 		 549 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06089  Heat shock protein 60 Precursor (60 kDa chaperonin)(Protein Cpn60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B041]  57.7 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.157793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  58.43 
 
 		 548 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0470  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  58.21 
 
 		 551 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6096  chaperonin GroEL  58.29 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  57.84 
 
 		 548 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1738  chaperonin GroEL  57.65 
 
 		 548 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  decreased coverage  0.00152275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  57.66 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  58.13 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  58.96 
 
 		 545 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  58.13 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  58.13 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  57.66 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03918  chaperonin GroEL  57.91 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2457  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 545 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1044  chaperonin GroEL  56.86 
 
 		 544 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5253  chaperonin GroEL  59.25 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  58.33 
 
 		 544 aa  616  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 550 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  58.52 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  59.09 
 
 		 547 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0177  chaperonin GroEL  60.42 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00120697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3026  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0844  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  56.8 
 
 		 544 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  57.09 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  58.75 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  59.09 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  57.28 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 547 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  56.72 
 
 		 544 aa  611  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2493  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  56.61 
 
 		 544 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0259197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.28 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  57.65 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  57.6 
 
 		 546 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  57.04 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  57.55 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  57.01 
 
 		 540 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  57.84 
 
 		 553 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>