More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24775 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  100 
 
 		 711 aa  1472    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  40.62 
 
 		 1067 aa  534  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  38.08 
 
 		 1193 aa  512  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  35.7 
 
 		 902 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  35.71 
 
 		 1901 aa  296  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  32.87 
 
 		 1259 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  36.1 
 
 		 1904 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.51 
 
 		 1848 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  34.09 
 
 		 956 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  34.44 
 
 		 821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  34.98 
 
 		 1222 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  33.59 
 
 		 1023 aa  280  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  31.16 
 
 		 898 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  34.5 
 
 		 1407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  35.43 
 
 		 1431 aa  273  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.33 
 
 		 1566 aa  273  7e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  34.56 
 
 		 970 aa  273  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1558 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  35.1 
 
 		 1769 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 1112 aa  272  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.71 
 
 		 1326 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  32.12 
 
 		 983 aa  271  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  34.5 
 
 		 995 aa  270  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 		 1021 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  35.19 
 
 		 1111 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  34.16 
 
 		 1096 aa  266  8e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  32.67 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  33.27 
 
 		 818 aa  265  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 1139 aa  265  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  31.7 
 
 		 545 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.6 
 
 		 1068 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 1055 aa  260  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  36.4 
 
 		 1070 aa  260  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 1125 aa  259  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 		 1082 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  31.46 
 
 		 1016 aa  256  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  32.52 
 
 		 522 aa  256  9e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  32.48 
 
 		 860 aa  256  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  32.18 
 
 		 833 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.27 
 
 		 1071 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  30.52 
 
 		 975 aa  254  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.7 
 
 		 1077 aa  253  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 		 1091 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  35.52 
 
 		 1082 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.58 
 
 		 1082 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1069 aa  251  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 1073 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.73 
 
 		 1087 aa  250  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  35.32 
 
 		 1082 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  34.75 
 
 		 1073 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 1073 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 1073 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 		 1066 aa  248  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 1414 aa  248  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  30.65 
 
 		 509 aa  247  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 1073 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.06 
 
 		 1068 aa  246  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.74 
 
 		 985 aa  245  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  33.47 
 
 		 495 aa  243  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.2 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  33.9 
 
 		 902 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  31.64 
 
 		 1069 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  34.02 
 
 		 1181 aa  242  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  33.8 
 
 		 1064 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.12 
 
 		 977 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  31.97 
 
 		 1517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  31.85 
 
 		 918 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  31.64 
 
 		 959 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.4 
 
 		 1064 aa  241  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  31.25 
 
 		 1069 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.67 
 
 		 1084 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.51 
 
 		 1080 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  32 
 
 		 1175 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 		 1104 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.4 
 
 		 1064 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  33.6 
 
 		 1064 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  33.6 
 
 		 1064 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  33.6 
 
 		 1064 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  33.6 
 
 		 1064 aa  238  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  33.6 
 
 		 1064 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  31.03 
 
 		 918 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  34.48 
 
 		 1070 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  33.4 
 
 		 1064 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 876 aa  237  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  31.03 
 
 		 918 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  33.13 
 
 		 479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  31.07 
 
 		 917 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.03 
 
 		 918 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 1068 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  34.6 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 933 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 918 aa  235  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.67 
 
 		 1084 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  30.83 
 
 		 918 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 		 1105 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 1108 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 982 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  30.83 
 
 		 918 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  30.83 
 
 		 918 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.83 
 
 		 918 aa  234  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>