121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24474 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  100 
 
 
264 aa  551  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  52.96 
 
 
255 aa  266  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  49.02 
 
 
253 aa  253  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  47.99 
 
 
285 aa  241  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  53.71 
 
 
231 aa  238  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  43.81 
 
 
238 aa  170  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  44.23 
 
 
259 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  39.76 
 
 
241 aa  169  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  43.72 
 
 
243 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  42.79 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  38.58 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  43.27 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.9 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  42.73 
 
 
242 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  43.48 
 
 
249 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  38.76 
 
 
245 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  37.34 
 
 
263 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.26 
 
 
243 aa  155  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  37.3 
 
 
235 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  40.38 
 
 
271 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  42.7 
 
 
240 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  35.06 
 
 
240 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.79 
 
 
250 aa  148  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  34.35 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.79 
 
 
241 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  40.28 
 
 
270 aa  145  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  39.91 
 
 
237 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  33.99 
 
 
241 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  37.04 
 
 
257 aa  145  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.55 
 
 
249 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  37.07 
 
 
246 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  34.48 
 
 
250 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  34.78 
 
 
248 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.34 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  40.45 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  36.45 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  41.11 
 
 
252 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  33.47 
 
 
258 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  36.02 
 
 
239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  34.91 
 
 
240 aa  135  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.79 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.84 
 
 
278 aa  131  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  38.46 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  35.65 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  40.32 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.11 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  34.66 
 
 
271 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  34.76 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  37.44 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  35.71 
 
 
245 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  38.04 
 
 
268 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  37.17 
 
 
247 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  38.2 
 
 
245 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  38.19 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  34.95 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  35.6 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  31.69 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  33.84 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  35.43 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.93 
 
 
299 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  36.56 
 
 
269 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  36.56 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  28.92 
 
 
246 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  34.64 
 
 
246 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  35.03 
 
 
238 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  29.89 
 
 
299 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  30.92 
 
 
259 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.65 
 
 
245 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  26.64 
 
 
236 aa  95.9  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.89 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  28.89 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.89 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  31.17 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  28.81 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  33.75 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.81 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.81 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.05 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.27 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.36 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.37 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  24.88 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  26.18 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.74 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.13 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.95 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.04 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.47 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  22.97 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  23.16 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  23.7 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  29.5 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  27.16 
 
 
198 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.95 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  24.53 
 
 
203 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.27 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>