224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24439 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24439  predicted protein  100 
 
 
357 aa  746    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01379  Putative uncharacterized proteinSONA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74224]  43.18 
 
 
362 aa  300  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.389246  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12608  predicted protein  45.16 
 
 
345 aa  299  6e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000194885  normal  0.0659856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77577  predicted protein  41.07 
 
 
365 aa  281  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140493  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00860  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 
366 aa  229  6e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02439  Spindle assembly checkpoint protein SLDB [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59902]  30.66 
 
 
357 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32949  WD40 mitotic checkpoint-like protein similar to spleen mitotic checkpoint BUB3  30.15 
 
 
397 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02770  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 
520 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13201  predicted protein  35.08 
 
 
322 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0928133 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25941  predicted protein  34.02 
 
 
305 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0246971 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57023  cell cycle arrest protein  28.03 
 
 
366 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.56 
 
 
682 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 
576 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 
1481 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
652 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 
1510 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.43 
 
 
1213 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 
1240 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.41 
 
 
865 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.96 
 
 
1553 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
1760 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.72 
 
 
677 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.39 
 
 
947 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.79 
 
 
1454 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.12 
 
 
1477 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22.84 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.89 
 
 
1789 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.72 
 
 
1163 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.23 
 
 
1221 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.31 
 
 
919 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 
696 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.81 
 
 
1267 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.13 
 
 
1363 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  22.79 
 
 
461 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.95 
 
 
1357 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.86 
 
 
1599 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.33 
 
 
1652 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 
589 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  21.95 
 
 
657 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.52 
 
 
1626 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.5 
 
 
716 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 
1557 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.14 
 
 
1217 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.25 
 
 
737 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  21.01 
 
 
464 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.48 
 
 
1262 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 
1344 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.6 
 
 
1416 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  21.85 
 
 
511 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  24.24 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
1211 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.16 
 
 
930 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.78 
 
 
1661 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.17 
 
 
1711 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  21.45 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  22.11 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.67 
 
 
1242 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.41 
 
 
742 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.99 
 
 
833 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.92 
 
 
1686 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.21 
 
 
1214 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.51 
 
 
1398 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.59 
 
 
1656 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  21.8 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  21.8 
 
 
780 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.7 
 
 
740 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.83 
 
 
1607 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  26.75 
 
 
485 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.84 
 
 
1190 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.54 
 
 
898 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.64 
 
 
1583 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.45 
 
 
1901 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 
1183 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.6 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  23.26 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  21.31 
 
 
1176 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
687 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.48 
 
 
1523 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.06 
 
 
630 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 
578 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.22 
 
 
1598 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23 
 
 
642 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.17 
 
 
1236 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  29.01 
 
 
522 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.11 
 
 
1364 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  27.81 
 
 
813 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 
540 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.08 
 
 
1858 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  24.8 
 
 
324 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 
1188 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.78 
 
 
1856 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 
1411 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 
1474 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.19 
 
 
842 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.24 
 
 
1823 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28 
 
 
1609 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 
1348 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.33 
 
 
924 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>