261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23871 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_23871  aspartate aminotransferase  100 
 
 
426 aa  895    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00950  Aspartate aminotransferase, mitochondrial precursor, putative  55.97 
 
 
453 aa  465  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01993  aspartate transaminase, mitochondrial (Eurofung)  52.05 
 
 
429 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.303718 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31597  predicted protein  52.13 
 
 
399 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.955549  normal  0.45996 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00360  aspartate transaminase, putative  52.01 
 
 
413 aa  425  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0699842  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23059  aspartate transaminase  50.38 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80440  aspartate aminotransferase  41.91 
 
 
439 aa  362  6e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06048  aspartate transaminase (Eurofung)  46.37 
 
 
445 aa  359  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.175084  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  46.29 
 
 
398 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  46.29 
 
 
398 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 
399 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  45.34 
 
 
398 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  44.76 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  44.84 
 
 
398 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
396 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 
397 aa  339  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
398 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
396 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  43.58 
 
 
398 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  44.5 
 
 
398 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66059  aspartate aminotransferase  42.21 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  43.59 
 
 
397 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  43.59 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  43.59 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  41.77 
 
 
397 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  42.82 
 
 
398 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 
397 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
396 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
397 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  43.19 
 
 
396 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  41.13 
 
 
399 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  41.9 
 
 
396 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  42.16 
 
 
396 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  41.9 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  43.19 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  41.69 
 
 
397 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  41.75 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  40.76 
 
 
398 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  40.8 
 
 
402 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  39.85 
 
 
396 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
401 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
397 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  40.25 
 
 
400 aa  316  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  40.87 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  40.87 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  40.87 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  41.13 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  41.65 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08709  aspartate transaminase, cytoplasmic (Eurofung)  41.58 
 
 
416 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  41.12 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  39.35 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  41.12 
 
 
398 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  41.62 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  41.15 
 
 
399 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 
399 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
396 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  40.87 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  40.21 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  41.56 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  40.21 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  42.01 
 
 
396 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  41.06 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  42.18 
 
 
402 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  302  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  39.69 
 
 
396 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  39.69 
 
 
398 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  41.24 
 
 
399 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  41.52 
 
 
399 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  41.46 
 
 
398 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  41.24 
 
 
399 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  39.43 
 
 
396 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  39.43 
 
 
396 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  39.18 
 
 
396 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  37.11 
 
 
396 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
398 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
398 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>