21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23706 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_23706  predicted protein  100 
 
 
150 aa  286  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0031909  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  35 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  35.46 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  33.76 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  36.24 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  31.97 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  31.97 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  32.64 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  39.09 
 
 
237 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  33.11 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  31.47 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  35.66 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  29.25 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  30.64 
 
 
189 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.29 
 
 
211 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  30.72 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  34.38 
 
 
151 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  29.45 
 
 
200 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  34.44 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  32.71 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  31.37 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>